IC卡可以存兆字節，磁卡最多只能存儲數百個字節。IC卡內部有RAM、ROM、EEPROM等存儲器可以存儲文本、聲音、圖形、圖像等信息，存儲區域可以分割，具有不同的訪問級別。
2.加密：
IC卡可以加密，磁卡不能加密。磁卡沒有控制電路，因此其內部數據讀寫不能安全控制，讀取技術也是順序和機械的，而IC卡可以控制電路讀寫其內部數據，擦除控制和讀取技術是隨機的。加密的IC卡本身有一個安全密碼。如果您試圖非法訪問數據，該卡將被自毀，不能再讀寫。
3.對網絡的依賴:
IC卡可以脫機，磁卡不能脫機。使用磁卡時，應確保終端與主機之間的強實時性。一旦主機或網絡故障，整個系統將癱瘓。IC卡可以存儲大量數據，并由邏輯電路控制。使用時，所有操作均由終端獨立完成，以降低計算機網絡在應用環境中的實時性和敏感性要求。
4.使用壽命：
磁卡使用壽命短，一般壽命在一到五年之間，而IC卡可達十年以上。
5.抗干擾方面：
磁卡在防磁、防靜電、防水等方面都比較差，而且磁條不能亂擦，而IC卡在這些方面都比較強，只要芯片要保持清潔。
6.防偽方面：
磁卡容易偽造，而IC卡本身具有很強的邏輯加密性，使得偽造率更加困難。
7.使用方便：
IC卡讀寫設備比磁卡讀寫設備簡單可靠，成本低，易于推廣和維護。
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